Маліков помер на 75-му році життя після тривалої хвороби.
В СБУ зазначили, що Маліков очолив службу в перші роки незалежності і доклав максимум зусиль до її становлення.
Прощання з генерал-полковником Валерієм Маліковим відбудеться 3 січня 2017 року в Клубі культури і мистецтв СБ України.